ho dato un occhiata al programma, e ho fatto un paio di modifiche.
Ora dovrebbe andare.
Il problema per cui non cancellava il file era che quando andavi a leggere il nome del file dal file Lista_files.txt leggevi anche il carattere newline (\n) e quindi andavi a dare come parametro alla funzione remove() una stringa sbagliata(con il carattere \n).
Ricordati che quando rinomini un file, devi cambiare anche il nome nel file Lista_files.txt
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