Intendi che se apri l'eseguibile con un editor di testo si leggono alcune scritte?
Se si basterà aprire il file in binario, criptare con una chiave ogni carattere letto e riscrivere l'eseguibile.
L'unico problema è che una volta aperto (per eseguirlo) bisogna decriptarlo quindi i suddetti eseguibili li dovresti aprire con un apposito programma implementato da te che prima li decripta poi li apre e in eseguito li re-cripta...
Naturalmente i tempi si allungano un pochino...
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